A crise no museu começou em 2018, quando ficou fechado por uma semana em fevereiro e voltou a funcionar após pagamento da dívida. Ao longo dos meses, todas as medidas foram tentadas por parte da fundação, inclusive a campanha #SomosTodosCabangu, porém sem nenhum resultado, culminando no fechamento do local na última segunda-feira, 14. A assessoria da prefeitura confirmou o atraso nos repasses, mas com a dívida do Estado com o Município de cerca de R$12 milhões, os serviços essenciais e a folha de pagamento tiveram prioridade. Ainda de acordo com a assessoria, os valores serão repassados até fevereiro para a fundação.
